Вами при увольнении работников в силу п.4 ст. 7 Закона РФ «О ЗАТО» от 14.07.1992 N 3297-1 выплачиваются суммы среднемесячного заработка в течение 6 месяцев, то есть работники в связи с увольнением получают суммы среднемесячного заработка в шестикратном размере.

Абзацем 2 п.4 ст.7 указанного закона предусмотрено, что «высвобождаемым работникам предоставляются другие льготы и компенсации в соответствии с законодательством».

Таким образом, для понимания верного исчисления НДФЛ с рассматриваемых сумм необходимо обратиться к гл. 23 НК РФ.
Согласно п. 3 ст. 217, гл. 23 НК РФ не подлежат налогообложению (освобождаются от налогообложения) НДФЛ все виды установленных действующим законодательством компенсационных выплат (в пределах норм, установленных в соответствии с законодательством Российской Федерации), связанных с увольнением работников, за исключением суммы выплат в части, превышающей в целом трехкратный размер среднего месячного заработка или шестикратный размер среднего месячного заработка для работников, уволенных из организаций, расположенных в районах Крайнего севера и приравненных к ним местностях, производимых в виде

— выходного пособия, среднего месячного заработка на период трудоустройства;
— компенсации руководителю, заместителям руководителя и главному бухгалтеру организации.

Таким образом, по общему правилу при выплатах в связи с увольнением работникам не облагаются суммы среднемесячного заработка не превышающих трехкратных размер; исключения составляют случаи выплаты среднемесячного заработка в связи с увольнением работникам, уволенных из организаций, расположенных в районах _______ и приравненных к ним местностях, у данной категории работников не облагаются суммы среднемесячного заработка не превышающих шестикратный размер.
Учитывая положения п. 3 ст. 217 НК РФ, а также тот факт, что если конкретное закрытое территориальное образование не приравнено к районам районах Крайнего севера, можно сделать вывод, что при осуществлении выплат работникам в связи с увольнением в части превышающих трехкратный размер после 01.01.2012 возникает обязанность по исчислению и уплаты НДФЛ.
Аналогичная позиция высказана в письме Минфина РФ от 26.03.2012 N 03-04-06/6-72.

Обратите внимание, что в силу ст. 226 НК РФ обязанность по исчислению и уплаты НДФЛ лежит на лице, выплачивающем доход, в рассматриваемом случае — бывшем работодателе. Уплата НДФЛ при получении не позднее дня фактического получения в банке наличных денежных средств на выплату дохода, в случае перечисления дохода со счетов налоговых агентов в банке на счета налогоплательщика в этот же день (п.6 ст. 226 НК РФ).

Если организации производила выплаты в адрес уволенных работников с нарушением положений п. 3 ст. 217 НК РФ, необходимо поступить в следующем порядке:

— если налог не удержан, но выплаты в 2012 году еще будут производиться, то при последующей выплате налоговый агент вправе удержать суммы своевременно не удержанного НДФЛ, но не более 50% выплат (п.4 ст. 226 НК РФ).
— если налог не удержан и выплаты в 2012 году производиться не будут, то в силу п. 5 ст. 226 НК РФ необходимо направить в налоговый орган сообщение о невозможности удержать налог и сумме не удержанного налога по форме, утв. Приказом ФНС РФ от 17.11.2010 N ММВ-7-3/611@, в срок не позднее одного месяца с даты окончания налогового периода.

Обратите внимание, в том случае когда налоговый агент не удерживает налог в срок установленный в законодательстве он подлежит налоговой ответственности по ст. 123 НК РФ в размере 20% от суммы, подлежащей удержанию и (или) перечислению. Начисление пени на данные суммы действующим законодательством не предусмотрено, но, по мнению, Президиума ВАС РФ (Постановления от 12.01.2010 N 12000/09, от 22.05.2007 N 16499/06, от 26.09.2006 N 4047/06, от 16.05.2006 N 16058/05) такое право у налогового органа есть, только в названном судебном акте суд не определил период за который пени начисляются; на практике налоговые органы начисляют пени с даты, следующей за днем перечисления НДФЛ и до даты решения по результатам выездной налоговой проверки. Предъявить требование об уплате НДФЛ при увольнении работника и отсутствии у него источника дохода в Вашей организации налоговые органы не вправе.

Консультант эксперт
ДМБУ ГК «Аудит-Классик» Кирсанова В.Б.